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Introducción a modelos de dinámica poblacional y evaluación de recursos marinos

05 Oct 2009 - 09 Oct 2009

Agenda Description

Information

Program(s) in charge: Stock Assessment Program

Staff: Alexandre Aires-da-Silva

  • Organización del curso: Biólogo Jimmy Martínez, Subsecretaría de Recursos Pesqueros del Ecuador, Ministerio de Agricultura.
  • Horário: 09:00–13:00h (mañanas), 14:30-17:30h (tardes); Pausas para café: 10:30–11:00h (mañanas); 16:00-16:30h (tardes).
  • Equipo necesario: una computadora portátil por persona, proyector, pizarrón de marcador borrable.
  • Software necesario: Microsoft Excel 2003 o 2007 (preferencialmente 2007, versión en español); subrutina “Solver” de Excel (instrucciones para instalar el Solver); lenguaje R (instrucciones para descargar y instalar el R); editor Tinn-R; y Acrobat Reader para abrir los archivos PDF de las clases teóricas.
  • Requisitos: Cursos básicos de matemáticas, estadística, y biología pesquera.
  • Número máximo de alumnos: 15

Type Details Dates Theme
T0 Theoretical class PDF 05 Oct, Morning Introducción al curso
T1 Theoretical class PDF 05 Oct, Morning Introducción al modelado de poblaciones
T2 Theoretical class PDF 05 Oct, Morning Modelos simples: exponencial y logístico
Lab1 Laboratory ZIP 05 Oct, Morning Modelos simples: ejercicios aplicados a la población de la foca gris
T3 Theoretical class PDF 05 Oct, Afternoon Modelos agregados
Lab2 Laboratory ZIP 05 Oct, Afternoon Modelos agregados: ejercicios aplicados a la población de la ballena franca boreal
T4 Theoretical class PDF 06 Oct, Morning Modelos demográficos: tablas de vida
Lab3 Laboratory PDF 06 Oct, Morning Construcción de una tabla de vida para el tiburón rabón bueno
T5 Theoretical class 06 Oct, Afternoon Estandarización de datos de captura por unidad de esfuerzo (CPUE)
Lab4 Laboratory 06 Oct, Afternoon Estandarización de CPUE con modelos lineales generalizados: ejemplos en lenguaje R con datos de la CIAT de atún patudo y datos de una pesquería artesanal de Ecuador
T6 Theoretical class PDF 07 Oct, Morning Modelos estructurados por edad
Lab5 Laboratory ZIP 07 Oct, Morning Modelos estructurados por edad simples: análisis de rendimiento por recluta para el atún patudo
T7 Theoretical class 07 Oct, Afternoon Relación stock-recluta (SR)
Lab6 Laboratory ZIP 07 Oct, Afternoon Incorporación de una relación stock-recluta en un modelo de rendimiento por recluta: continuación del ejemplo de patudo
T8 Theoretical class PDF 08 Oct, Morning Ajuste de modelos a datos: método de los mínimos cuadrados
Lab7 Laboratory ZIP 08 Oct, Morning Ajuste del modelo de Schaefer a los datos de CPUE de merluza: método de los mínimos cuadrados
T10 Theoretical class 08 Oct, Morning Análisis integrado
T9 Theoretical class PDF 08 Oct, Afternoon Probabilidad y verosimilitud
Lab8 Laboratory ZIP 08 Oct, Afternoon Ajuste del modelo de Schaefer a los datos de CPUE de merluza: método de la máxima verosimilitud, construcción del perfil de verosimilitud
Lab9 Laboratory 09 Oct, Morning Análisis integrado: demo con modelo estadístico estructurado por edad

Description

El estudio de la dinámica poblacional, es decir, de los factores que afectan los cambios en la abundancia de una población con el tiempo, es imprescindible para la evaluación y manejo sustentable de los recursos marinos vivos, o de cualquier población animal.

Para este propósito, el investigador tiene a su disposición un conjunto diverso de herramientas. Entre ellas figuran varios conceptos básicos de biología y ecología de poblaciones, así como modelos matemáticos que puedan representar de una forma adecuada el sistema biológico que se estudia. En cada sistema biológico se pueden colectar datos con sus características propias, por lo tanto es importante contar con conocimientos de varios modelos específicos que potencialmente sean idóneos para cada problema en estudio. Es también fundamental el dominio de métodos estadísticos que permitan al investigador “confrontar” modelos y datos, y también caracterizar la incertidumbre del sistema. Por último, y para poder aplicar todos estos elementos de manera integrada, el investigador necesitará varias herramientas de computación.

Este curso se puede considerar como el primero de una serie de sesiones de entrenamiento en el modelado de la dinámica de poblaciones y evaluación de su estado de explotación. Su objetivo principal es proporcionar la motivación, iniciación y bases generales necesarias para el uso de estas herramientas cuantitativas modernas. En lugar de utilizar un programa de modelado y evaluación ya preparado, el estudiante aprenderá las diferentes fases del modelado de poblaciones: la conceptualización de un modelo basado en las características del sistema biológico en estudio y de los datos disponibles, su implementación computacional, y la interpretación de los resultados.

El curso está orientado a estudiantes en los últimos semestres de la carrera universitaria y a estudiantes de posgrado en ciencias marinas con formación básica en matemáticas, estadística, y biología pesquera. El enfoque del curso es muy práctico, y se basa en el uso de Excel como herramienta principal de análisis.

Los archivos de las clases teóricas y prácticas (los “laboratorios”) serán colocados en el sitio web del curso en el día anterior de su presentación. La dinámica de trabajo del curso consiste en varias charlas teóricas de corta duración, seguidas por los laboratorios prácticos con Excel. En estos laboratorios, el estudiante trabajará con varios tipos de modelos de dinámica poblacional, incluyendo los modelos más simples (exponencial y logístico), modelos de biomasa agregados, y modelos estructurados por edad. Para ajustar los diferentes modelos a los datos, trabajaremos con dos métodos de estimación: mínimos cuadrados y máxima verosimilitud. El curso está enfocado en recursos marinos y problemas de explotación pesquera. Trabajaremos con ejemplos aplicados a poblaciones marinas con diferentes estrategias de vida, incluyendo mamíferos marinos (foca gris y ballena franca), peces cartilagíneos (tiburón rabón bueno), y peces óseos (merluza y atún patudo).

Una de las clases estará enfocada en métodos de estandarización de datos de captura por unidad de esfuerzo (CPUE). Esta es una etapa crítica para la obtención de índices de abundancia fiables para uso en modelos de dinámica poblacional. Esta clase proporcionará a los alumnos una introducción al lenguaje de programación R.